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PCR實(shí)驗(yàn)室分區(qū)能杜絕污染嗎?分3區(qū)還是4區(qū)?

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目前PCR實(shí)驗(yàn)室建設(shè)要求至少應(yīng)該分為三個(gè)區(qū)域,即試劑準(zhǔn)備區(qū)、核酸制備區(qū)和PCR擴(kuò)增區(qū),如果要對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行開(kāi)放性鑒定,如雜交、電泳等操作,原則需要增加第四個(gè)區(qū)。實(shí)驗(yàn)室分區(qū)的主要目的是避免純化核酸和擴(kuò)增產(chǎn)物逆向污染前一個(gè)區(qū)域,但多年的經(jīng)驗(yàn)表明,無(wú)論是三區(qū)還是四區(qū)的設(shè)置,似乎都沒(méi)有完全杜絕實(shí)驗(yàn)室污染的發(fā)生。


反而羅氏COBAS“一體機(jī)”引入實(shí)驗(yàn)室后,乙肝20IU/ML的敏感性能夠長(zhǎng)期保持良好,極少有系統(tǒng)污染的發(fā)生,實(shí)驗(yàn)室分區(qū)的意義受到一定程度的質(zhì)疑!仔細(xì)對(duì)比就不難發(fā)現(xiàn),羅氏COBAS并不能避免樣本交叉污染,因?yàn)檫@一環(huán)節(jié)是由實(shí)驗(yàn)室工作人員完成的,是管理問(wèn)題而不是檢驗(yàn)問(wèn)題;COBAS在核酸制備過(guò)程中,經(jīng)常發(fā)生核酸純化的Tip頭吹出氣泡和氣泡破裂的情況,雖然這種情況并不常見(jiàn),但核酸純化和試劑分配共用一個(gè)空間是事實(shí),有研究報(bào)道,COBAS檢測(cè)28個(gè)樣本,有2個(gè)污染(JCM, 2011,P2854-2858),我們也從21個(gè)陰性樣本中發(fā)現(xiàn)一個(gè)污染,COBAS的污染就像普通實(shí)驗(yàn)室一樣存在,但令人驚奇的是,從未像普通實(shí)驗(yàn)室那樣發(fā)生系統(tǒng)性污染,但有一點(diǎn)可以說(shuō)明,氣溶膠或許并不是實(shí)驗(yàn)室污染的主要原因。


分析我國(guó)大多PCR實(shí)驗(yàn)室的檢測(cè)項(xiàng)目不難發(fā)現(xiàn),近80%的實(shí)驗(yàn)室采用熒光PCR試劑盒進(jìn)行臨床檢測(cè),即這部分實(shí)驗(yàn)室不存在開(kāi)放性核酸鑒定環(huán)節(jié),試劑工作液的配制多在核酸制備完成后進(jìn)行,依存“試劑配置與PCR擴(kuò)增之間的時(shí)間越短越好”的原則,多數(shù)實(shí)驗(yàn)室的試劑配制均在核酸制備室完成,也就是說(shuō),試劑配制室的存在基本被忽視,了解了羅氏COBAS的操作方式,這種做法便顯得無(wú)可厚非!核酸制備完成并加入PCR反應(yīng)液后,移管到擴(kuò)增室,由于采用封閉核酸鑒定的方法,這樣擴(kuò)增室的設(shè)置也同樣顯得多余!以羅氏COBAS為鏡,臨床PCR實(shí)驗(yàn)室是否分區(qū)便顯得無(wú)足輕重了!但這并不是說(shuō)PCR實(shí)驗(yàn)室不需要分區(qū),因?yàn)閮x器自動(dòng)化控制的機(jī)械臂,與實(shí)驗(yàn)室操作人員的操作習(xí)慣和對(duì)規(guī)則的執(zhí)行力是有著本質(zhì)差別的!這或許就是經(jīng)過(guò)嚴(yán)格分區(qū)后的實(shí)驗(yàn)室,污染同樣存在的主要原因!

那么PCR實(shí)驗(yàn)室究竟應(yīng)如何建設(shè)才能有利于污染的預(yù)防和有效清除?

其實(shí)污染就是PCR擴(kuò)增管中摻入了原來(lái)樣本不存在的擴(kuò)增核酸,那么這個(gè)不受歡迎的核酸是怎么來(lái)到PCR擴(kuò)增管里的?如果排除試劑盒、儀器和人員操作等環(huán)節(jié),核酸氣溶膠和灑落的樣本與核酸的清除是實(shí)驗(yàn)室建設(shè)應(yīng)該重點(diǎn)考慮的環(huán)節(jié)。

實(shí)驗(yàn)室的建設(shè)首先要有通風(fēng)設(shè)置,通風(fēng)是PCR實(shí)驗(yàn)室建設(shè)應(yīng)該考慮的基本條件,如果采用封閉彩鋼板建設(shè)的實(shí)驗(yàn)室,應(yīng)進(jìn)行壓差設(shè)置,即自試劑準(zhǔn)備室、核酸制備室到擴(kuò)增室依次呈負(fù)壓,但清潔新風(fēng)應(yīng)從室外引進(jìn),新風(fēng)過(guò)濾網(wǎng)應(yīng)定期更換,否則便成為污染的來(lái)源。其次是實(shí)驗(yàn)室墻面和地面具有防水功能,也就是墻面和地面可以水洗!每個(gè)房間設(shè)置地漏,方便“實(shí)驗(yàn)室的清潔”,當(dāng)實(shí)驗(yàn)室污染發(fā)生時(shí),即可使用“水洗實(shí)驗(yàn)室”的方法有效清除污染,清除過(guò)程使用的是0.2%有效氯溶液,它不但有效斷裂核酸片段,而且還具有淬滅熒光基團(tuán),有利于PCR實(shí)驗(yàn)室熒光本底的去除。但過(guò)量使用反而會(huì)影響試劑擴(kuò)增效率。消毒液清洗后應(yīng)該使用自來(lái)水或清潔水進(jìn)行再次清洗,特別是設(shè)備表面。實(shí)驗(yàn)室空氣中的污染清除,可以用有效氯溶液進(jìn)行噴霧。

總之,PCR實(shí)驗(yàn)室過(guò)度分區(qū)和分割,不但浪費(fèi)空間,影響人員操作,常常不利于污染物的擴(kuò)散和清除,相信在不久的將來(lái),隨著試劑盒技術(shù)的發(fā)展,一個(gè)房間可實(shí)現(xiàn)PCR的試劑準(zhǔn)備、核酸純化和PCR擴(kuò)增的所有功能,而污染的預(yù)防和清除也會(huì)顯得十分簡(jiǎn)單。
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